アンドロイドのスマホを使用しています。 最近、スマホを操作する度に 「問題が発生したためFacebookを終了します」というメッセージが出ます。 OKをク

>無効化(無効にする)ならスマホに悪影響は無いんでしょうか？

ないです。
だって主さんの言う不具合やウィルスがどうのってのは無理にプログラムを削除する行動であり、無効化はそれではなくAndroidの仕様だからです。

おそらくミスタップで開いたアプリのキャッシュとストレージの影響などでそのようなエラーが出てるのではと推測します。
だとしたら無効化した後でアプリのキャッシュも消去したほうがいいだろうなって気がします。

ちなみに私はiPhoneユーザーですが、親がAndroidなので調べて得た知識です。上記のページもそのエラーダイアログの文言をコピペして検索して調べたものです。主さんもそうやって調べてレベルアップするといいですよ。