別居中の旦那とやり直した方がいいのでしょうか？

結婚や離婚は人に言われてするものではありません。

ただ親の気持ちもわからなくはないです。
今の今まで宙ぶらりんの状態で居候されてたら、そう言いたくもなります。

でも
懐くとかは違います。
親の身勝手な別居や離婚に振り回されるのは子供です。
夫婦は離婚して他人になるが、親子は親子なんです。
離婚しても今と変わらない行き来をしてあげられない環境なら、実家から自立する道も考えましょう。
5年も別居していたら主さんも経済力付いていると思います。

別居解消するなら、別居した原因(姑問題)を解決しなくてはならない。
原因を解決しないまま別居解消したらまた同じ事になりますよ。
その時、今みたいに実家に居候出来るとは限りません。

別居解消するにしろ、離婚するにしろ、このまま別居生活をするにしろ
真剣に考えなくてはならないと思います。