薬を服用しているのにインフルエンザの予防接種を受けました

薬剤師ではないですが、病院勤務です。

服薬の確認は、基礎疾患の確認です。
予防接種は、身体に抗原を入れて自ら抗体を作らせることで、免疫を獲得させます。
つまり、今現在抗がん剤や免疫抑制剤を服用し、薬により免疫力が低下している場合、新たに身体にムチ打って抗体を作らせるのはかなりの負担になるのです。

その確認のための予診票なので、それらのお薬なら特に問題ないはず。

単純に、予防接種の影響だと思います(身体が抗体を作るのに体力消耗しますから)。
数日で回復するでしょう。
長引くようなら受診してくださいね。