幼稚園年少の男です。 三歳年上の兄と同じ幼稚園へ通っています。 兄は三年保育で、入園時はオムツしていましたが、担任の先生と連絡取りながら夏休み前にはなんとか

先生によって対応が違うのは仕方ないというかあり得ることなので、よく話し合うしかないし、それでどうしてもダメなら他園に移るか、頑張ってトイレ訓練させて自身で考えて行動できるようにさせる方が早いかもしれませんね。
ただ、それよりもアレルギーの方が深刻かと思いますのでこちらについては園長にも話した方がいいのでは？
何かあってからでは遅いですしね。