先日長男の就学時健診がありましたが、数日後に教育委員会から電話があり、「知能検査の点数がギリギリでした、お母さんが気になる事があったり、幼稚園で何か指摘された事

私は専門家ではないので、なんとなくですが、緊張から間違ってしまったり、恥ずかしさから「わからない」と答えてしまう子はいると思います。

でも、相談に行く余裕があるのなら相談に行かれたほうが安心だと思います。

私の息子（４歳）の場合ですが、IQは100を超えていますが自閉傾向があります。
自閉傾向とはいっても人見知りは少なくて、どちらかというと人懐っこい子です。
ただ想像力が足りない部分が自閉傾向とあてはまります。
想像力が足りないと相手の気持ちを想像する力も足りないので、質問者の意図も想像できない時があります。
例えばですが、「象は大きいよね。じゃあアリは？」と子供に聞いたら、多くの子は「小さい」と答えられると思います。でも私の息子は２回に１回は「虫」と答えてしまう感じです。
私の息子は目からの情報は得意なので文字や数字は好きですし幼児向けドリルを自分からやりたがりますが、耳からの情報だけだと会話が成立しない時があります。
象とアリの大きさの会話も絵を見ながらならサイズの質問なんだと理解できます。

うちの子みたいな場合もあるので役所の人は念のため連絡したのだと思います。