40代 既婚男性です 排尿時に違和感があり泌尿器科で受診したところクラミジアに感染していました。 性交渉は妻以外には一切ありません。 これは妻が浮気か不倫

クラミジアは粘膜からの感染なので、トイレや銭湯での感染はほぼ有り得ません。AIDSを発症していて免疫力が著しく低下してるとかなら有りえるかもしれませんが通常では有り得ませんので、奥さんとしかしていないなら奥さんが持ってると思います。
潜伏期間を考えたら1.2週間前の行為で移ったのかな？

粘膜に感染するので、アナル、咽頭にも感染するようです。すぐに奥さん病院に連れていった方が良いかも？
もしかすると、先に気付いてもう治療して直してる可能性もあるかもだけど。