私は高1和太鼓に入ってます。和太鼓である日公演に出る選抜の練習があり、私はその日お盆でお墓参りがあり、行けませんでした。そしたら、部活の同級生からなんで？やすん

ちゃんと伝わってなかったのかなあ。
それとも、若いから「お墓参り位別にええやん。」的に思われたのかな。

どちらにしても、
「事前にLINEで伝えたのだけど、身内の（仮に先祖のだけだったとしても、この方が近い親戚感が出るので）お墓参りだったの。大好きな○○（曾祖父母か祖父母等で亡くなった誰か）なので…ごめんなさい。」
と言えば一般的には「仕方ない」と思ってもらえるはずですし、本来許されることです。

それでも、部活が「休むのは悪」という雰囲気なら謝り続けるしかありません。

ただし、伝わってなかったのは主さんにも落ち度が。
墓参りは前日に急に決まる訳でもないでしょうから、LINEだけで済まさず口でキチンと先輩や周りの同輩、先生にも言っておくべきでした。大事な日なら尚更。
仮に、急に決まったことでもLINEより電話等で直接伝えた方が丁寧です。

ウチも高校１年の娘がいますが、部活を何らかの事情で急に休むことになった場合は、LINEだけでなく電話もしなさいと伝えています。
最低でも、先生は学校にいらしている訳ですから、生徒が誰も捕まらなくても先生にだけは連絡が取れるはずです。

もう、過ぎてしまったので仕方がない。
LINEに記録は残っているでしょうし、謝っている内に雰囲気もきっと緩和されますよ。

変わらなければ先生にも相談してみて。
何が何でも絶対来い！ってタイプでない限り、大人だからお墓参りが大事なことはわかるはずですので、上手く伝えてくれるかも知れません。
あまり一人で抱え込まないでね。