実家で子育てしています、今日母親から、「赤ちゃんを泣かせっぱなしにしてネグレクトが！お母さんが抱っこしたら泣き止むでしょ？！」と言われ、母親が殴る振りをしてきた

保健師さんに全てを相談できてますか？
別居との事ですが、今後ご主人とは離婚される方向なのでしょうか？

主さんが子供の時からお父様の暴言等があったなら、主さん含めみなさんが自分の事でいっぱいいっぱいの状態ですよね
鬱にはまわりの理解が欠かせませんが、サポートする側がキャパオーバーになれば主さんのような自体も予期出来ない事ではないのかもしれません

それなら保健師さんに相談だと思います
その上で必要ならば児童相談所への相談もしなければならないでしょう

市町村の子育て相談等も調べてみて下さい

しかし、社会混乱とも言える状態ですので、なかなか難しいかもしれませんね…