持病の悪化は自業自得だと言う上司や同僚に医師は異なる見解を示したことを伝えますか？それとも伝えず静観しますか？ 失礼します。39歳男性、気管支拡張症という持病

根本として、上司は主さんの姿勢（20代の時に治療を勧めていたのに言うことを聞いてくれず治療はしないという自分を押し通した主さんが結局今は治療してる）が未だに納得いってないんだと思いますよ。
医師の診断がどうあれ、人の思いやりや心配する気持ちを無下にしたことにはなりますので、自分だったらまず謝ったと思います。
「せっかくずっと心配してくださっていたのに素直にアドバイスを聞けずに申し訳ありませんでした。当時は自分も若くてそのような思いにきちんと向き合えず気づけずにいました。今は上司さんがずっと心配してくれていたことが痛いほどわかります。本当に申し訳ありませんでした。今後もなにかとご面倒かける場合があるかもしれませんが、仕事は精一杯頑張るつもりですので、よろしくお願いします。」って。
それでまず様子をみますね。そして仕事は一層頑張ります。