休職中のまま辞めたいです。

辞めるなら職場の人事?か更に上の人に洗いざらい話して辞めましょう。
本当に相性のあわない上司が最低なら休職までしている訳なんですから会社側としても何か対策考えてくれると思います。
確かに２週間前には辞めると言わないといけないようですが、どうしてもダメなら仕方がないと思います。
有給消化で辞める手もあります。
引き継ぎは主さんをそこまで追い詰めたその上司にやらせればいいんです。
だいたい皆の前で見せしめのように叱るなんて、パワハラじゃないですか。
社会人としては失格かもだけど、そいつのせいでそうなった訳だし、主さんだけが無責任だとは言えない気がします。