電話で謝って許してもらえたみたいな感じになって２、３秒の沈黙の後に相手が電話を切ろうとすることはあり得ると思いますか。

謝罪を『用件』に置き換えて回答します。まず電話を掛けたのは主さんですよね？　用件を話し、相手は承諾した。この時点で用は済んでいますから、相手からすれば通話を続ける理由がありません。

わたしが電話相手なら沈黙になった瞬間に切ります。電話が苦手なので、用件だけ言ったらサッサと切ってしまうタイプです。

それと謝罪の件ですが、もし直接会える人なら、きちんと顔を見て謝ったほうが良いですよ。電話も良いですが「逃げている」と受け取って不快になる人もいるので。