名前は仮名です。 私は、同じ集落にみほちゃんという友達がいます。みほちゃんと私には同じ四年生の子どもがいます。みほちゃんは車の免許がなく、酷い雨の日はうちの子

難しいですね。
私個人的な意見は３さんと同じです。

しかしながら、主さんにも様々な事情があり思うところがあるでしょうから、ここはみほさんに『あのね、友達だと思うから敢えて言う。気に障ったらごめん。』と前置きした上で、みほさんのお嬢さんが学校でどうやら意地悪をしているらしいこと、それによって自分の娘が雨の日に一緒に帰る事を遠慮したいと思ってしまっていること、正直にお話してみてはどうでしょうか。

みほさんが人としてマトモなら、一時的に関係がこじれても主さんとは大人として付き合うことは可能でしょう。
でも、もし、主さんの話を聞いてキーッとプンスカするなら、それはそれで仕方ないのでは。主さんにとってはお嬢さんを守ることが優先だから。

理想は３さんが仰っているような形ですが、そうでなければ、みほさんとの縁が切れることも覚悟で送迎の遠慮を申し出てみるのも、また一つの形ではないでしょうか。