度々不機嫌になる友達がいて困っております。 その子とはオタク友達で好きな漫画がほぼ被り毎日語っても飽きないくらい楽しいのですが時折不機嫌になります。

私の友だちもそんな子でした。

ご友人には失礼かもしれませんが、「私は怒っているぞ」とアピールすることで相談者さんの優位に立って、コントロールをしたいのではないでしょうか。
それか、ただうまく切り替えられない人なのか…。

なんとなくですが、相談者さんは何かあっても言い返さないひとなのではないですか？
優しく対応することも大切だと思いますが、少し距離をおいたりして、「あなたのその対応が、私も不快に思うことなのだ」とその時だけ、アピールしては？
そして、その次の日からは「昨日はごめんね」と一言伝えて、普通に接してあげればいいのではないでしょうか。

ただ、小さな喧嘩がいじめ等の大きなものになることもあります。慎重に大丈夫だと思う範囲でご友人に伝えてみてはいかがでしょうか？