小6の息子が専門機関の検査で 学習障害などは無い自閉症と分かりました。 そこの担当医師と合わず 母子共にとても傷付く発言が多々あり もうここに通いた

セカンドオピニオンを受けてみても良いと思います。

医師の質によって、正確に診断されているのかわからない場合も考えられます。それに医師との相性もあります。

また発達障害について、ご自身で勉強し、理解を深めることも良いと思います。発達障害にも様々なケースがあるので、息子さんに合う方法でケアをすることが望ましいのではないでしょうか？

父親の件に関しては、本人に聞いてみないとわかりませんが...おそらく、自身にとって不利な状況に追い込まれると理解しているため、父親には反抗しないのだと思います。