虫歯　1mm程度の綺麗な薄黒い穴が空いていました。見た感じ深さはそこまでではないと思うのですが…。綺麗にぽつと空いています。普段からとても丁寧に歯磨きをしていた

痛みがあるなら神経まで虫歯が行ってる証拠。
見た目よりもひどい事になってるから、一日でも早く歯医者に行った方がいいよ。
今の歯医者はかなり技術が向上してるから、すぐに銀歯にはならないで何とかなると思うけどね。
歯磨きについてだけど、丁寧にやってても虫歯になる人はいるよ。
虫歯になるのは歯磨きの仕方だけじゃなくて、本人の虫歯耐性の方が影響力が強いらしい。
元々の虫歯になりにくい歯の質だとか、睡眠時の唾液の量(虫歯を防ぐ最も大きい要因と言われる)だとか、歯磨きのタイミング(食事してから3分以内)とかもそうだし、間食を取ることも影響するみたい。

自分もちゃんと歯磨きしてるのにしょっちゅう虫歯になってた。
昔から通ってた歯医者では「歯磨きの仕方が悪い」と言われ続けて、ずっとその通りやってたのに虫歯は収まらなかった。
評判の良い歯医者に変えて、そこで相談したら「あなた、鼻が悪いでしょう？」といきなり言われた。
歯医者なのに鼻の事は関係ないと思ってたけど、「あなたは鼻が悪くて詰り気味だから寝た時に口呼吸になってるはず。口呼吸になってると口の中が乾燥するから、睡眠中に虫歯菌が増殖してしまうんですよ。歯はこちらで治すけど、耳鼻科に行って鼻もちゃんと治さないと虫歯は減らないですよ。」と言われた。
言う通りにして鼻も治してもらったら、本当にそこからは虫歯は出来なくなってビックリした。
虫歯の原因を的確に見定める優秀な歯医者を選ぶのも重要だと痛感したよ。