妹とどう関われば良いのか

その親友の方は向こうからきちんと話がこないなら縁切っても良いんじゃないですか？
親友のいない間にその妹と(しかも高２)…なんて、失礼ですがまともな社会人の行動とは思えません。
その状況では妹を守るのは主さんしかいないので間違った行動ではないと思います。

大変だとは思いますが妹さんが嫌がってもきちんと話すべきだと思います、和解できると良いですね。