妻とどう接すれば良いのでしょうか？

カウンセリングは誰の為のどのような？奥様はもう無理でしょう。他の手段を探すしかないのでは？

キリスト教は普段の生活ではそれ程の制限は無いように思いますが、神社や仏壇などの日本文化やそれに関わる行事など、全く違うと思います。

夫婦で別の宗教って方もいるようですが、割り切らないとやっていけないかと思いますので、奥様とその辺の話し合いも必要かと思います。