会社の総務の人たちがうざい上司 (部内の取り纏め役)を抜きにして部内で グループラインしてるんですが、 それを容認してる部長や他の上司もどうなんでしょうか

周りも注意しません、というより、
休む時は直属の上司に連絡をする、というのは、
読み書きそろばんレベルの一般常識なので、
お母さんみたいにいちいちそんなこと指摘しませんよ。
その若手が特別駄目なだけだと思います。
グループラインはあくまでもプライベートなことなので、
上司がそれについて何か言えば、パワハラになる可能性があります。