もうすぐ11か月になる赤ちゃんの事なのですが ９ヶ月を迎えた頃からウィルス性の胃腸炎、胃腸風邪によくかかっているのです。 治ったかなと思ったらまたとゆう

母乳やミルクはまだ飲んでますか？
離乳食は？

下痢するなら、いちど離乳食を中断して、母乳やミルクのみに戻したほうがいいかもしれません。

便秘したり下痢したりということは、単純に胃腸に負荷がかかっていると思うので、一番負担の少ない母乳やミルクに戻したほうがいいと思います。
1日に必要な栄養素のうち、1歳の時点で80%、2歳でも50%は母乳ミルクから栄養が取れるそうです。
　
あとは、無菌・抗菌しすぎていませんか？
　
赤ちゃんの腸は生まれたときは無菌です。
そこから、周囲の菌を舐めとって、腸内環境を整えていきます。
無菌にしすぎると、腸内細菌がうまく育たない場合があるそう。

自然の多い場所に行って、葉っぱや土を(本人がやりたがるようであれば)舐めさせたりしてみては。
（ただし、公園の立ち木や生垣は消毒がかけられている可能性があるのでNGです。山に行ってください。）

子どもは、小腸の長さが大人と同じになるのが4歳くらい、腸内細菌群が大人と同程度に育つのは10歳くらいだそう。
　
生まれつき弱いかどうかなんて、まだぜんぜんわかりませんよ。
その程度では、ただの個体差だと思います。
　
長い目で見て観察していく必要があると思いますよ。