投資信託で使われるような口座は特定口座と呼ばれますが、銀行にお金を預ける際に使う普通口座とは違うのでしょうか？ よろしくお願いいたします。

普通預金口座はお金を預けるだけであり、そこにはお金の出し入れなど決済機能もあります。
一方、証券会社の特定口座には、お金を剃物を預けるということではなく、投資信託や株式現物などを管理する口座であり、MRFのような預金に近いものもファンドであることに違いはありません。その口座で一元管理することで、売買の損益をまとめて管理して、税金の処理なども口座内で通算できるというものです。