インドは旅行しにくい国だと思うのですが、 旅行会社のツアーなら快適でしょうか？

移動手段を探すとか価格交渉なんかが面倒ということなら、確かにツアーのほうが気楽だと思います。
ただ、実際には1/10くらいの価格でできることを、日本の旅行会社や現地の旅行会社さらにその下請けの会社などに払ってやっているということになるので、その差額をもったいないと思わない場合のみです。

インドはほんとにピンキリで、女性の一人旅なら安全第一でしょうが、そうでなければホテルは少しいいところにして移動手段は現地調達にする等で費用は半分近くになったりします。