いい加減退職するべきでしょうか。 現在新卒入社６年目（大卒）になり、４年ほど所属していた職場から突然異動を言い渡され、現在新職場に勤めています。

身体に支障が出てるようなら無理をする必要はないと思います。
身体が人間資本ですからね。働くために大事なことです。

あと一方の考えでは新しい環境は、慣れるまで、仕事がある程度できるまでには
仕事内容にもよりますがだいたい半年はかかります。
最初の3ヶ月くらいは辛いことの方が多いと思います。
こういうものだと努力したり自身を気休めしたりしながら辛い時期を
なんとか凌ぐと1年後には暗いトンネルを抜けて状況はだいぶ変わっているとは思います。

ただ主さんの仕事環境が分からないことや世の中にはブラックな企業環境もあるので
一概に辛抱した方がいいとは言えないです。

ここで愚痴を言うのも息抜きのひとつだとは思います。
何も参考にならなかったかもしれませんがご参考までで。