交通費とは？ 私はA型作業所に通っています。 私の通ってる作業所は、送迎ありで、送迎なしでいい人には、1日100円の計算でお給料にプラスしてきます。

１kmで交通費が出る会社はほとんどないと思います。
しかし、今までもらえてたお金がなくなるのはつらいでしょうね。
今回の場合は、あなたの交通費をなくしたいのか？それとも、これから入ってくる人も１km以内は無しにするのか？です

さらに、従業員に不利益のある変更には同意が必要な点が論点になります。

質問者さんはわかりましたと言ってしまったなら同意した事になりますので諦めてください。
ただ、モヤモヤをなくす為に全員に通達をお願いすることは可能だと思います。福利厚生の変更なので、会社には通知義務があると思われます。