学童で働いているのですが。私に数年前から片想いしてる男性(既婚者)の子供が学童に来て困っています。その男性の子供は色々問題があり私の働いている学童に来てる事事態

被害届→警察から連絡ってことですね。
では相手方に接近禁止法命令は出されましたか？
被害内容が見えてきませんが、明確な被害と感じたのはどういう点でしょうか。

お子さんが支援学校に行くか否かの問題は、ストーカーの問題とは別件な気がしますが、お子さんの希望で学童に行きたいと言ってるんですね。お父さんではなく。
そして診断があるお子さんということですが、ご病気は？
お子さんの問題行動というのも見えてきません。
具体的にはどのような？