九万円の住民税

税金ですから未納だったら理由はどうあれ支払わなくてはなりません。
給料から差し引かれていなかったということはその間住民税を収めてないことになります。支払いが困難なら役所に行って相談されてみてはいかがですか？
減額になるわけでもありませんが、知合いは年４回払いのところ支払い困難な為月１万の支払いにしてもらってました。
放置などしておくと財産差押えになるかもしれません。