長年お世話になっている業者さんに、3～5千円の金券を贈りたいのですが、多すぎます…

少額でも忖度です。
ビールセットか菓子折りの方が妥当かと思います。

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いや、金券はやめたほうが良いと思う。
そもそも主さんはお客さんなんですよね？相手は仕事なのだから、気遣いは必要ないかと。

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決して多すぎることはありません。
長年お世話になっているとのことですので、その金額は感謝の意を示すのに適切と考えられます。
一般的に、取引先や業者への季節のご挨拶（お歳暮やお中元）の品物の予算は、3000円から5000円程度が相場とされています。

企業によっては、従業員が取引先から金品を受け取ることを制限する社内規定がある場合があります。事前にそれとなく確認できるとより安心です。

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