私は今高校三年になるのですが、現在学校に行けていません。 それはいじめをうけたわけでもなくて後輩の子のことで・・・ その後輩は一番私の中で大事な人です。

後輩に尽くしたい、という気持ちなのだと思います。
主さんが休んだから後輩も休んだ、というのなら、主さんが登校することで後輩も学校に来るようになるかもしれません。
いろいろ詮索(せんさく)するのは虫のサナギを開けさせるような感じでよくないと思います。意外と軽い気持ちで解消することもあります。
ちなみに、今後の話になりますが、主さんと後輩は同じ大学に行かれるのでしょうか?そうでないから、気楽にかまえるとよいと思います。