50代男です。妻との関係が悪く離婚もやむ無しと考えています。ただ、子供がまだ幼く、そのことが気がかりでなりません。離婚したら父親は親権を取れないのでしょうか？私

お子さんが幼い場合、どうしてもお母さんに親権が行きがちですが、これは一般にお父さんがお母さんよりお子さんの世話をしていないことが原因です。
例えば、お子さんを朝起こして着替えさせ、朝ごはんを作って食べさせて、幼稚園や保育園に送り迎えし、お弁当が必要なら持たせてやり、帰ったらおやつを用意して一緒に遊んでやり、晩御飯を作って食べさせ、お風呂に入れてパジャマを着させて寝かしつけることを毎日やっているかいないかなんですよ。
そして、それを離婚後も続ける態勢（覚悟も当然に含めて）がお母さんより整っているということを示さないといけません。
たしかに、日常的にお子さんを虐待しているなどという事実があれば、かなり決定的な理由となりますが、そういうものを示す必要もあります。他にもレスがあるように証拠集めは重要でしょう。
なお、離婚にあたって家庭裁判所で親権を争えば、状況次第ではありますが、家裁調査官がご両親やお子さんへの面接などを行なって養育状況の確認をして、親権の帰属について意見を示すこともあります。