授業中に泣く人は、廻りに負い目や劣等感があるし、苦手なことが刺激になるからですか？ 実際にクラスメイトに、おこられたり注意されたり、バカにされてるから？

なぜ泣く理由が知りたいのかよく分かりませんが、その人でないとわからないと思います。

具合の悪くなった親族が心配で涙が出る。
話しかけられた言葉が責められているように感じた。
皆が理解できることが理解できなくて悔しい。
特に自分でも訳が分からず涙が出る。(月経中・月経前にこんな感じになる人もいます)
パニック障害などストレス性の涙。

卒業式で号泣する人と普通にいられる人。
同じ映画を観ても、感動する場面が人それぞれ違う。
それくらい理由も沢山あって、気にしてほしい、慰めてほしい人もいるでしょうし
逆に、ひとりにしてほしい、少し放っておいて、という人もいるでしょう。

その泣いた人とどういう関係性か分かりませんが、その人が気になるから知りたいのでしょうか？
適度な距離を計りつつ話しかけてみてはいかがですか？
そうではないのなら特に気にする必要はないのではないでしょうか。

主さんもクラスメイトに、今自分が何を感じ、思っているかなんて全てさらけ出したりはしないでしょう？