彼のメールの真意は？

他のレスやお礼は読んでません。

正直言って、主さんがウザいとか云々は関係なく…好きな恋人にそのようなメールを送るのか？が問題です。
人とお付き合いする上で本当に好きな人なら例え忙しかろうが、機嫌が悪かろうが、相手に嫌われたくないから、そのようなメールは送りません。二年間続けたメールなら習慣になってても不思議じゃないし、本来…主さんからメールがないと不安になるぐらいですよ。それなのにそのような自分本位なメールを寄越すのは、自分の都合ばかりを主さんに押し付けたいのだと思います。
話し合いが必要だと思います。