レジ員の後輩がダウン症……。

私も38さんの意見には同調し難いです。
あくまでダウン症の親目線の発言だとしか思えません。
周りが理解して育てれば幸福をもたらす？
一瞬の出合い頭のハプニングなら助けますけど仕事場という何時間も拘束された空間で付きっきりで助けてもらえて当たり前な訳無いです。
何故主さんが職場を去らなきゃならない？
いずれにしてもレジのような不特定多数の人間と接する持ち場では遅かれ早かれクビか配置転換になるとは思います。
横レスになりましたが主さんは重荷に感じる事は無いですよ。
店長に責められたら本部や人事に相談すれば良いと思います。