退職に追い込んでしまったこと

課長が辞める件は会社の上層部が決めた事で主さんが気にする事はないです。
でも主さんは優しすぎる人柄のようなので、気になりますよね。
多分このまま会社に残っても居づらいですよね。
２日にもう一度行くなら、課長が辞めるのは今回の件が原因なのか、それなら考え直せないか?と話してみては?

主さんは多分よく言えば優しい、悪く言えばつけ込まれやすいスキがあるんでしょうね。
今後気をつけたほうがいいですよ。