この間、自分が残業で忙しかった時に、後輩の同僚女子が手伝ってくれて早く帰れました。 すごく助かったので、感謝しきれず、LINEで俺は彼女にこう言いました。

貴方にご飯に誘われて「狙われている」と思っているのかも。
普段から2〜3人くらいでご飯や飲みに行くような間柄じゃなければ、ちょっと贅沢なお菓子をあげるくらいのお礼で済ませた方が、相手からも好印象だったのでは、と感じました。

そして、嫌ならいいですけど、の一言が余計です。

後輩さんはプライベートの予定が多いのが本当なら、時間が作れずに断りたいけど「嫌だから断ります」という意味に捉えられそうで、後輩さんも後輩さんで気まずいとか…