未成年の時

医者には守秘義務がある…んじゃなくて誰にでも守秘義務はあります。
ただし、医者には守秘義務に関する「例外」があります。それは生命にかかわる事由に関してです。患者や患者の家族（赤ちゃんも）の生命に関して重大な局面や状況が生じた場合は本人を除く家族に相談をすることは不思議なことでも何でもありません（分かりやすく言うと、患者が癌だった時に本人に告知するかを家族に相談する状況など）。
例えば、子宮外妊娠などを起こしていたり、胎児に以上が見られた場合などは以前の妊娠歴なども含めて家族と相談することはありうることです。

スレ主さんの幸せを考えた時、将来のことを考えたときには、母親にだけは知らせておいたほうがよいと思いますよ。同じ女性だしあなたの母親なんだから分かってくれると思いたいですね。