大学受験についてです。 私は現在、近畿の(自称？)進学校に通っている高校2年生で、そろそろ進路の方向性を本格的に決めていかなければならない時期になりました。

関西は関東より国立志向が強いからね…。（我が家も関西、上の子は東京の国立、下の子は地元の専門学校）

だから、基本的には高校側は国立を勧めてくると思います。
主さんが今行きたい大学がハッキリしているならそこでいいのではないですか。

御両親と主さんの間で意見が纏まっていて、且つ先生に言われるのが面倒だったら適当に国立の名前書いておいたらいいと思いますが、それが進路のクラス分けに左右されるならわざわざ行きたくもない教科のクラスで学ぶこともないと思うから貫き通したらいいと思います。

ガチ進学校だと国立の東京阪神で学年で何十人もいるだろうけど、そうでなかったら結局それぞれ一桁か多くて十数人ポチポチいるだけ。学校側がそのポチポチの中の一人にさせたいが為に皆に「国立！国立！」と言っているに過ぎません。
進路を柔軟に考えることには賛成ですが、行きたくもない東京の国立を視野に入れて悩む必要性はないと思います。