悩みへの回答に一定数いるそもそも論してくる人は、本当に解決したいと思っていない、ただ正論に屈して黙るのを見て発散したいだけの人なんだなと思ってしまうのですが、実

それらは「身も蓋もない回答」というものです。論破したことにもなりません。
ですが「そもそも」を使うからといって全てが全てそういった身も蓋もない内容とは限りません。
私が「そもそも」を使う時は質問者の文章の中で前提がはっきりしていないか前提がねじ曲げられている場合です。
例えば
「私は美人じゃないので死なないといけません」みたいな質問に「そもそも不美人が生きちゃいけない決まりなどないですよ」とか。
「そもそもの発端とか背景はなんなんです？」とか。

前提をはっきりさせることや、間違っている前提を正すあるいは疑うことは、問題解決や議論(ここでは議論はしないけどね)、基本ですしね。