約6年前、外付けHDDにデータをフォルダごとに分けて入れていました。 その数ヶ月後の雨が降っている日、外付けHDDを誤って開けている窓の近くに置いてしまい多少

>①データが消えた原因は何ですか？

平たく言えば濡れたから。
濡れたらいけない理由は、濡れたことで回路の通電してはならない部分に水を介して通電、すなわちショートする。
通電部やプラッターなどが錆びて性質が変わってしまう。錆びるっていうのは化学変化だから科学的に違う物質になる。

「消えた」という認識は正しいとは言えず、「読み出せない」という表現が妥当。
水濡れからしばらく時間経過しているので、もしかしたら乾燥していてショートの可能性は少ないかもしれないが、その程度。
十分な時間が経過したので、錆びているであろうとは想定される。

>②この状態でデータを、データを復元してくれる業者にお願いしたら復元出来ますか？

1.錆びた部分がデータを物理的に保存しているプラッター以外ならば、錆びたパーツを正常なパーツに交換すれば「読み出せる」かもしれない。
2.プラッターが錆びていたとしても、錆びていない部分からデータを「読み出せる」かもしれない。

1はバラして見てみないことには分からないし、2もやってみないと分からない。