長文になりますが、読んでいただけると嬉しいです。 20歳女です。バイト先の1つ歳上の社員の男性から食事に誘われました。もともとよく話しかけてくれていた人で

少なくとも真っ当な会社員であれば犯罪まがいなことを考えてる人はいませんよ。
そんなことをすれば会社からクビにもなりますし、主さんとは同じ同業者である以上嫌われる様なこと迷惑なことをしたら自分(彼)の立場も危うくなりますよね。

ですがなかにはそんなこともお構い無しに犯罪をしてしまう大人は沢山います。

警戒心を持つこともけして悪いことではありません、むしろ大事です。
職場だけしか知りえてないなら余計相手に対して不安になるでしょうが、とりあえず冷静にきちんと帰宅出来るくらいの食事をして会って話してくればいいと思います。