契約社員だと、上司からの指示は聞かないといけないのでしょうか？ 自分ばかり同僚の嫌がる重労働をやらされます。 大人しく聞いていましたが腰を痛めてしまいました

ケガをするとわかっている仕事をわざわざ命令はしないと思いますよ？そんな事をしたら、間接的だけど傷害罪になってしまいませんか？
業務上、それが重労働であれば、体を痛めてしまうのはよくある事でしょう。ただ、その業務を主さんにばかりやらせる…ということの証明は難しいかと。出来れば毎日日記を付けましょう。その業務についた日時と作業時間をつけるのです。それを持って労基に相談するのです。主さんが言われている主張(自分にばかりやらされているという部分)が通ればパワハラが認定されるかもしれません。
ただし、主さんが他の業務が出来ない(能力的に)、またはその業務は主さんの担当業務…ということになればまた話が違ってくると思います。