妻が子供が嫌いだと言います。 カウンセリングや病院を勧めるも、断固拒否され困っています。 お知恵を貸してください。 結婚3年、2歳の子供がいます。

お子さんは、栄養状態や情緒面は大丈夫でしょうか？

一度、役所の「子育て支援課」（住んでいる所で名称が違っていたらゴメンなさい）
に現状を相談された方がいいかもしれないですね。

２歳となるとこれから、自我が強くなり好き嫌いが出たりイヤイヤ！が増えて我が子を愛おしくて仕方ない母親でもイライラしてしまうほど手が掛かってくる時期に突入します。

これまでの奥様の状況で日中２人にさせるのは火に油を注ぐようなものです。

遠まわしに書いていますが、率直にお伝えします。
虐待になる前にお母さんとお子さんを日中離してください。
「子供を施設に入れて・・」なんて、考えられないのが普通かも知れません。
もちろん、その通りです。
でも悲しきかな、そういう考えの（自分の欲が一番の）親がいるんです。
人の奥さんを悪く言える人間ではありません。きっと辛い事もあるんでしょう。
でも小さな命を守ってあげれるのはあなただけです！