会社から子供は児童福祉施設に預けろ。と言われました。

普通ではありません。
主さんのご想像通り、そんなことが奥さまの耳に入ったらとてもショックを受けると思いますよ。奥さまには言わないで。

でも……主さん、おいくつですか？
新卒で入った会社ということですが、まさか高卒の新卒で一年目とかじゃないですよね。
そういう若い年齢で結婚して子供作ってたら、多少、風当たりは厳しくなるかもしれませんね、人の感情として。
もちろん、だからと言ってその言い方が許されるとは思いませんが。