離婚をするので別居中です。住所変更はしてますが、離婚届けは未だです。 車はローン中なので名義は企業、使用者は旦那です。保険も本人又は配偶者でなっています。

自動車保険の契約者は旦那ですか？
で、その車を主さんが使ってるてことですか？

離婚してなければ保険は使える。
離婚したら使えないから主さんが新たに自動車保険に加入する必要あり。

車は今後もずっと主さんのもの？
厳密に言うと離婚後苗字も変わるだろうから車の名義と住所変更しないとダメです。
そのままでも掛けれるけど車両保険の被保険者は使用者になるし何かと面倒だから変えた方がいいですよ。
事故時や駐車違反など車両所有者（車検証の使用者）にも賠償責任が伴います。