今日すごく仲の良いバイトの先輩と喧嘩をしてしまいました。年は少し離れているのですが、冗談を言い合う仲です。ゲームセンターなのですが、私は普段1階で先輩は2階です

インカムあるあるですね...

インカム聞こえなくて何回も聞いたこと弁明済みなのでもうこちらからはいつも通り普通に接するしかないのでは？

けれど言い方
「ノイズが入って先輩の声うまく聞こえなかったです。何度も聞いてしまってすみません。」
と言った方が良かったかな。
原因はインカムの具合で主さんは悪くないから謝るのは納得いかないかもしれないですが先輩が不快になった決定打は主さんの行動ですから。
理不尽と感じるかもしれませんが。

それと
「そんなに怒ること？」
とか
「そんなに悲しむこと？」
は、あんまり相手に寄り添った言葉ではないですよね。
言わない方が良いかも。
それが怒りを助長させたかもしれない。

それに先輩は自分の返事が主さんに伝わってると思ってますから。
その場合トイレだって言ってるのに何度も聞かれたら嫌でしょう。
何度も聞いた主さんが悪いと言ってる訳じゃないですよ。
ひどく怒っている理由を言ってるだけです。