恐らく、アスペルガー症候群だと思われるクラスメイトがいます。 頭はいいけど、とにかく行動がおかしくて学年全体から嫌われています。 けど、病気として診断されて

何かのグレーゾンかもしれませんが、
２番の方が言うように、愛情、友情を注ぐ時だと思います。

何かの縁で結ばれた級友でしょう？

「保健室行かなくて大丈夫？」とか「どうしたの？」とか声くらいは掛けてあげても良いんじゃないでしょうか？

いじめもせず、仲間外れにもせず、クラス全体で守って行く姿勢だ求められます。

残念ながらこの文面では、それが感じ取れません。
改善して下さい。全員でね。