姉の車(新車)を傷付けてしまいました。 実家の方から持って帰りたい物があり、大きさ的に姉からは難しいかもと言われていて無理そうだったら諦めてと言われていたので

> 姉から運ぶ時に無理じゃない？大丈夫これ？などとは言われていましたがハッキリダメと断られなかったので良いのかなと思って‥

主さんは信用(=条件付きで相手を信じること)ではなく、お姉さんから信頼(=無条件で信じること)されていたんですよ。
なのでおそらくショックだったんだろうと思います。

とにかく今は、お姉さんの感情に一区切り着くまで待って、落ち着いたらまた改めて修理代について話したら良いかと思います。