現在結婚して1年半、1ヵ月の息子がいます。 妻の実家近くに引っ越して1年半が経ちます。 僕の実家は茨城県の自営業、妻の実家は香川県のお寺です。僕は兄妹の長男

私も3さんと同じで、故郷を捨てる覚悟で香川に来たのなら今更心変わりして文句を付けても…と思います。
寺の仕事内容を少しずつ覚えていく必要があるのなら、結局そのまま神奈川に居続ける事になるのではないでしょうか。

でも、奥さんも「お寺を継ぐ必要性もなかった、保育園を通う頃には神奈川に戻りたい」と同じ意見なら、義両親の許可は求めず神奈川に戻ってもいいのでは？
その場合、お寺を継ぐ話は無くなりそうな気がします。