出る杭は打たれるタイプの娘。 娘に悪いところがあるのでしょうか。 ちなみに、出る杭を打ってくるのは特定の子らしく、その他のクラスメイトは、むしろ好意をも

もしかしたら、ですけど

ほかのクラスメイトから好意を抱かれたり男子とも仲良い

これが気に食わないのかも

私も同じような理由で特定の人に当たりを強くされたことがあります、小学生のとき。
嫉妬による逆恨みみたいなもの。
クラスメイトにAちゃんがいて、その子はAちゃんが好きだから（友達として）私が仲良くしてるのも気に食わないし、男子と仲良くしてるのも気に食わない。

実際にお子さんの学校の様子は見れないから想像ですが、逆恨みによる当たりの強さは、中学でも経験したことあるので、割とよくあるのかなと思います。
子どもって、そんな理由で？と言うことで平気で無視したり仲間外れしたりしますよ。