結婚生活6年目の子供は5歳の娘と4歳の息子がいます 妻が家を飛び出していきました。 それまでに何回か家出を繰り返していましたがその時は子供をつれて行

子供を置いて出ていく程、病状が悪く冷静に何も考えられない状況なのでしょうね。
お子さんもいる事ですし主さんから離婚など応えを急がない方がいいと思いますよ。
半年から一年は治療してもらい様子見て冷静に夫婦で話し合えてから結論出す。
離婚するにしても子供達と好きな時に面会できるとか、なるべく子供達に我慢させたり寂しい思いをさせないように気を配ってほしいです。
主さんや主さんのお母さんも大変ですが離婚しても今の奥さんは育てられないので暫くは中途半端ですがそういう時もあると思って今は子供達との時間を大切にした下さいね。