中３の姪がいるのですが、私の実家の一部屋に勉強机を置き、寝泊まりしています。実家の隣が自宅なのですが、家族の人数に対して狭い家なので、自分の部屋どころか皆で寝る

姪というのはあなたのお兄さんか弟さんのお子さんですか？
スレを読む限り姪ちゃんのお母さんはあなたの姉妹じゃなさそうですし、、、

まぁ姪のしつけや責任は基本姪ちゃんの両親にあるのであまり言えないですよね😅
でも、あなたのものは『これは私のだからさわらないでね』とか『使いたいときは声をかけてね』とか約束をした方がいいと思います。
家の中の食べ物に関しては、１の方もおっしゃっるように、祖母と孫の関係ではまあいいじゃん。よその家じゃないんだし、かたいこと言いなさんな。という感じなんでしょうね。
あなたは気になるようなので、食べてるところを見たら、そんな時間に食べるとお肌に悪いよ〜って言ってみたり、自分のものには名前を書いておいて予防するしかないかもですね😅