会社に大迷惑をかけてしまい、上司（女性）に「会社のあなたに対する信用はゼロです！」と言われました。 それ以来朝礼でも無視され、まるで私がいないような態度を取ら

上司の態度は本当に宜しくないと思いますが、おそらく上司はグループウェアの件だけで態度を変えたのではない気がします。「自分自身のことしか考えてない」←ここが問題なのかもしれません。「あなたに対する信頼はゼロ」←不注意について言ってるのではなく、同僚からの好感度はゼロだ、もしくは上司本人からの好感度はゼロだという意味だったのかもしれません。

業務上のミスよりも、人間関係のトラブル（ミス）の方がはるかに取り返しにくいものです。

今は時間経過とともに相手の感情が落ち着くのを待つこと、仮に主様に非があるのなら謝罪と改善を示すことしかできないかもしれないと思いました。

上司の態度は、管理職失格だと個人的には思ってますよ。